张晓鲁，M.D.，Ph.D，教授，博士生导师。山东大学齐鲁青年学者，山东省泰山学者青年专家。2014年毕业于瑞典卡罗林斯卡医学院肿瘤学专业获博士学位，2015年至2020年在瑞典生命科学研究中心/大数据研究中心从事博士后研究。2020年4月入职山东大学基础医学院生理学与病理生理学系及系统生物学系，担任病理生理学科以及系统生物学科的教学及科研工作。主要研究方向为肿瘤组学大数据分析、肿瘤克隆进化及异质性，以通讯作者及第一作者身份在Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology、Nucleic acids research、Nature Communications、Leukemia、Molecular Cancer等国际领先期刊发表SCI论文。

学习与工作经历：

2020年至今，山东大学基础医学院生理与病理生理学系/系统生物学系，教授，博士生导师

2015年-2019年，瑞典大数据研究中心/卡罗林斯卡医学院生命科学研究中心（SciLifeLab），博士后

2010年-2014年，肿瘤学专业，瑞典卡罗林斯卡医学院医学系，博士

2003年-2009年，临床医学专业，山东大学齐鲁医学院，学士

研究方向：

张晓鲁教授研究团队整合实验医学生物学和生物信息学手段，通过肿瘤多组学高通量测序技术及数据整合分析技术，结合动物模型解析肿瘤在发生及进展等演进过程中内部肿瘤克隆细胞的进化以及相关分子机制：1.从单细胞水平探索了人胆管癌内部高度复杂的异质性转录图谱及肿瘤微环境组成，相关研究成果以通讯作者身份发表于Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology、Nucleic acids research等权威期刊。2. 利用开发的全新全基因组扩增技术证实了乳腺癌内部广泛的异质性现象，研究成果发表于Nature Communications杂志，同时，这一研究成果受到了瑞典政府的科研奖励。3. 发现了急性早幼粒白血病中肿瘤细胞的克隆进化现象，相关研究成果发表于血液学领域权威期刊Leukemia、Molecular Cancer、Haematologia、Annals of Hematology等杂志。 

学术/社会兼职： 

获奖荣誉：

2020年，入选山东大学齐鲁青年学者

2019年，入选山东省泰山学者青年专家

本科生课程：

病理生理学；系统生物医学

研究生课程：

生命科学研究前沿进展

1. No. 82103036，基于多组学多因素的胆管细胞癌病例分子分型数学模型的探索及构建，国家自然科学基金青年项目，2022.01-2024.11，30万，课题负责人

2. No. ZR202102230144，早期胃癌多组学特征及肿瘤内异质性研究，山东省自然科学基金面上项目，2022.01-2024.12，10万，课题负责人

3. 2021A55220145，从单细胞水平解析KRAS突变逆转微卫星不稳定型结直肠癌免疫敏感性的分子机制研究，广东省基础与应用基础研究基金面上项目，2021.11-2024.10，20万，课题负责人

4．Tracing the roots of metastasis in breast cancer by multi-regional omics approaches, 瑞典Svenska Sallskapet for Medicinsk Forskning （SSMF） 研究基金项目，2016.05-2018.04，80万瑞典克朗，课题负责人

1. Pan L, Shan S, Tremmel R, Li W, Liao Z, Shi H, Chen Q, Zhang X#, Li X#. HTCA: a database with an in-depth characterization of the single-cell human transcriptome.Nucleic Acids Res. 2022 Sep 21; gkac791. Online ahead of print.

2. Li H, Qu L, Yang Y, Zhang H, Li X,Zhang X#. Single-cell transcriptomic architecture unraveling the complexity of tumor heterogeneity in distal cholangiocarcinoma.Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 13(5):1592-1609.e9 (2022).

3. Yu J, Zhang H, Zhang Y,Zhang X#. Integrated analysis of the altered lncRNA, microRNA, and mRNA expression in HBV-positive hepatocellular carcinoma.Life. 12:701 (2022).

4. Cheng Y, Bai F, Ren X, Sun R, Guo X, Liu W, Wang B, Yang Y,Zhang X, Xu Y, Li C, Yang X, Gao L, Ma C, Li X, Liang X. Phosphoinositide-Binding Protein TIPE1 Promotes Alternative Activation of Macrophages and Tumor Progression via PIP3/Akt/TGFβ Axis.Cancer Res. 82(8):1603-1616 (2022).

5. Li H, Qu L, Zhang H, Liu J.Zhang X#. A comprehensive transcriptomic landscape of cholangiocarcinoma based on bioinformatics analysis from large cohort of patients.Sci Rep. 11(1):13713 (2021)

6. Zhang X*, Garnerone S, Simonetti M, Harbers L, Nicoś M, Mirzazadeh R, Venesio T, Sapino A, Hartman J, Marchiò C, Bienko M, Crosetto N. CUTseq is a versatile method for preparing multiplexed DNA sequencing libraries from low-input samples.Nature Communications, 10(1): 4732 (2019)

7. Zhang X*, Zhang Q, Dahlström J, Tran AN, Yang B, Gu Z, Ghaderi M, Porwit A, Jia J, Derolf A, Xu D, Björkholm M. Genomic analysis of the clonal origin and evolution of acute promyelocytic leukemia in a unique patient with a very late (17 years) relapse.Leukemia, 28(8): 1751-4 (2014)

8. Zhang X*, Zeng J, Zhou M, Li, B, Zhang Y, Huang T, Wang L, Jia J, Chen C. The tumor suppressive role of miRNA-370 by targeting FoxM1 in acute myeloid leukemia.Mol Cancer, 11: 56 (2012)

9. Zhang X*, Li B, Yu J, Dahlström J, Tran AN, Björkholm M, Xu D. MYC-dependent downregulation of telomerase by FLT3 inhibitors is required for their therapeutic efficacy on acute myeloid leukemia.Ann Hematol, 97 (1): 63-72 (2018)

10. Zhang X*, Li, B, De jonge N, Björkholm M, Xu D. The DNA methylation inhibitor induces telomere dysfunction and apoptosis of leukemia cells that is attenuated by telomerase over-expression.Oncotarget, 6 (7): 4888-900 (2015)

11. Dahlström J,Zhang X, Ghaderi M, Hultcrantz M, Björkholm M, Xu D. Dysregulation of shelterin factors coupled with telomere shortening in Philadelphia chromosome negative myeloproliferative neoplasm.Haematologia, 100 (10): e402-5 (2015)